Distinct mycorrhizal communities in sympatric Lepanthes orchids revealed by long-read sequencing
该研究利用第三代长读长测序技术，揭示了同域分布的 Lepanthes 兰属物种拥有独特的菌根真菌群落，表明真菌伙伴的转变可能促进了该属物种的快速分化与多样化。
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plant biology
311 篇论文
Integrated Molecular and AI-Based Diagnostics for Banana Diseases: Development, Optimization, and Field Deployment of LAMP and Computer Vision Technologies
本研究开发并部署了一种结合环介导等温扩增（LAMP）分子诊断与深度学习计算机视觉技术的综合框架，通过简化提取流程、自产酶制剂及移动端离线模型，实现了对撒哈拉以南非洲香蕉病害（特别是香蕉束顶病毒）的快速、低成本且可扩展的现场检测与监测。
A novel TaNF-YC10-TaNF-YB1-TabHLH95 module coordinates starch biosynthesis in wheat endosperm
该研究鉴定出小麦转录因子 TaNF-YC10 作为淀粉生物合成的关键正调控因子，揭示了其通过与 TaNF-YB1 和 TabHLH95 形成复合物协同调控淀粉积累及粒重的分子机制，并证实了其在小麦育种中的选择价值。
Transformers Outperform ConvNets for Root Segmentation: A Systematic Comparison Across Nine Datasets
该研究通过对九个数据集上 21 种架构的系统比较，首次证实 Transformer 模型在根部分割任务中显著优于卷积神经网络，且预训练能大幅提升其性能，同时指出数据质量对最终结果的影响远大于模型架构的选择。
A specialized ARGONAUTE enables trans-species RNA interference in plant immunity
该研究揭示了拟南芥 ARGONAUTE10（AGO10）通过其 N 端内在无序区感知病原感染并发生相变，从而驱动跨物种 RNA 干扰（tsRNAi）这一进化保守的植物免疫防御机制。
Intragenic methylation repatterning is associated with alternative splicing and unique epigenetic phenotypes
该研究利用拟南芥 msh1 实验系统，通过单胞嘧啶分辨率的甲基化图谱分析，揭示了环境响应性的基因内差异甲基化通过调控可变剪接进而导致植物表型改变的直接机制。
Evolution of moss leaf-like organs through variations in deeply conserved developmental principles
该研究通过整合活体成像、遗传学及建模等手段，揭示了苔藓叶片状器官（叶状体）发育中生长素通过时空调控细胞分裂与伸长发挥保守作用，但其运输机制（依赖 PIN 蛋白降低胞内浓度而非极性运输）与维管植物存在显著差异，从而阐明了叶片趋同进化中保守发育原理与谱系特异性变异的结合。
Alternative splicing expands the functional portfolio of a plant virus to control the viral cycle
该研究揭示了番茄黄化曲叶病毒（TYLCV）利用宿主剪接体通过选择性剪接产生功能特化的 Rep 蛋白异构体，从而在缺乏中央寡聚化结构域的剪接变体抑制转录与全长蛋白启动复制之间建立平衡，以此调控病毒生命周期并增强侵染性。
A deep-time landscape of plant cis-regulatory sequence evolution
该研究利用 Conservatory 算法整合微共线性与迭代比对，在跨越 3 亿年进化的 284 种植物中鉴定出约 230 万个顺式调控序列，揭示了古老调控元件在发育基因附近的富集特征及其在基因组重排与谱系分化中的动态演化规律。
A visualization framework for cell division activity and orientation in pre-anthesis ovaries of Prunus species
本研究通过优化 EdU 标记、电子显微镜成像及机器学习检测，构建了一套可视化框架，揭示了桃、梅及其杂交种在开花前子房中细胞分裂活动广泛分布但分裂方向具有区域特异性（外果皮主要为径向分裂、中果皮主要为周向分裂）的三维调控模式。
A scalable approach to inoculate plant viral vectors into plant tissue using non-pathogenic, transgenic galls
该研究提出并验证了一种利用携带柑橘黄脉病毒-1 的转基因虫瘿（共生体）作为载体，通过农杆菌介导将植物病毒载体规模化接种至柑橘等植物体内并实现系统性感染的创新方法。
Enhanced phenylalanine biosynthesis amplifies light-stress-driven phenylpropanoid production in Arabidopsis
该研究通过多组学分析表明，增强苯丙氨酸生物合成可缓解其作为前体的供应限制，从而在强光胁迫下协同放大拟南芥中苯丙烷代谢物（特别是花青素）的积累。
Resistance Breaking in Root-knot Nematodes Carries a Fitness Cost Associated with Defective Feeding Site Development
该研究揭示了根结线虫突破番茄 Mi-1 抗性基因虽然使其能在抗性品种上存活，但会导致其在易感宿主上因取食位点发育缺陷和宿主转录重编程减弱而付出显著的适合度代价。
Direct effector recognition by a tandem kinase triggers non-canonical immunity in wheat
该研究克隆了小麦抗锈病基因 Lr41 及其病原菌效应子 AvrLr41，揭示了 Lr41 作为一种串联激酶通过其假激酶结构域直接识别效应子，并招募辅助蛋白（CC 蛋白或全长 NLR）来激活非经典免疫反应，从而扩展了作物抗病蛋白的功能谱系。
MGIDI selection and machine learning reveal harvest index driving traits in sodium azide-induced rice mutants with SSR-based genetic diversity
该研究利用叠加重力指数（MGIDI）和机器学习方法，结合 SSR 标记遗传多样性分析，成功鉴定出由叠氮化钠诱变产生的水稻突变体中受收获指数驱动的高产优异株系，为加速水稻遗传改良提供了宝贵种质资源和现代育种策略。
Melatonin alleviates acid-induced stress and improves peanut (Arachis hypogaea L.) growth in a dose-dependent manner
该研究证实外源褪黑素通过激活抗氧化防御系统、调节氧化还原稳态及上调质子泵基因表达，以剂量依赖方式显著缓解酸性胁迫对花生生长的抑制，并在受控及自然酸性土壤环境中均展现出提升产量潜力的应用前景。
Ovothiol A mediates singlet oxygen resistance and acclimation in Chlamydomonas
该研究揭示了卵硫醇 A 是莱茵衣藻中一种此前被忽视的关键抗氧化剂，其通过 OVOA1 酶介导的生物合成途径响应单线态氧信号，对藻类抵抗光氧化胁迫和实现光适应至关重要。
Aberrant GPX4 processing reveals its critical roles in maintaining ROS homeostasis in Citrus
该研究揭示了柑橘中 CsGPX4 因发生特异性截短而改变亚细胞定位并产生显性负效应，进而破坏 ROS 稳态并引发氧化胁迫表型，阐明了其在柑橘氧化还原调控中的关键作用及独特的蛋白加工机制。
HONEY PRODUCTION IN FOREST AREAS: CHARACTERIZATION OF 5 HONEY SAMPLES FROM SOUTHERN COTE D'IVOIRE
该研究通过对科特迪瓦南部森林地区 5 份蜂蜜样本的花粉分析，鉴定出 54 个花粉类群，证实了这些蜂蜜（包括一份单花蜜和四份多花蜜）具有极高的花粉含量和天然品质。
T2T Genome and Population Resequencing Reveal OfCCD4 Alleles Orchestrate Petal Color and Scent in Osmanthus fragrans
该研究通过构建桂花端粒到端粒（T2T）基因组及群体重测序，鉴定出 OfCCD4 基因的三个等位变异是调控花色（橙红与黄白）与花香（β-紫罗兰酮）之间权衡关系的关键因子，并开发了共显性分子标记以辅助育种。